Справку ГНИ даёт ТОЛЬКО на основании Вашей-же отчетности!
Если Вы на ЕН, то ТОЛЬКО валовый доход!
Вот если бы Вы были на общей системе н/о, то ... сами поняли?!
Другого выхода здесь нет.
Или пока не вести деятельность, показывая в отчетности нули, чтобы справка была пустая.