Подскажите, пожалуйста
Какое количество цифр после запятой нужно учитывать при расчете налогов?
Есть ли официальные документы по этому поводу?

Например:
если зарплата работника 1200.00грн (+ используется налоговая льгота)
то при расчете ндфл получится:
1. если учитывать три знака после запятой 87,50грн.
2. если учитывать два знака после запятой 87,49грн.
Как правильно?
Разница в 1 копейку. Наша налоговая удавиться из-за копейки.

Если честно, то сколько знаков учитывать после запятой никогда не думала... у меня программа сама начисляет зарплату и НДФЛ так там постоянно идет округление в большую сторону т.е. 87.50

Дело в том, что программы считают по разному.
Например
ifin насчитал 87,49грн.
а медок 87,50грн.
Эта 1 копейка при проверки может вылиться в кучу гемороя.

заплатите 87,50.
Зачем Вам думать о возможном геморрое, при цене профилактики в 1 коп?