как правильно проиндексировать з/п, если з/п работника в 2006 г 200 грн (400 гр на 0,5 оклада) за все месяцы ?

Если работник-совместитель, то в первую очередь ему должны индексировать зарплату по основному месту работы (там, где ведется трудовая книжка). А по дополнительному месту только в случае представления работником справки с основного места работы.
Для индексации нужно определить базовый месяц - месяц поступления на работу или месяц последнего повышения зарплаты.